Em 27 de agosto de 1883, o vulcão produziu a maior erupção já documentada, arremessando rochas e cinzas a mais de 27 mil metros de altura. O som de sua explosão foi tão intenso que pode ser ouvido a mais de 5 mil quilômetros de distância e é considerado o ruído mais elevado já produzido na Terra. De acordo com especialistas, todo o Planeta reverberou por mais de 9 dias seguidos.
Antes da grande explosão, havia na região três grandes ilhas: Rakata, Denan e Perboewatan e sobe essa última Kracatoa erguia-se a quase 2 mil metros de altitude. Após a explosão, Denan e Perboewatan foram reduzidas a pó, enquanto Rakata teve seu flanco oriental praticamente desintegrado.
Diariamente, Anak Kracatoa expele cinzas e material vulcânico, que o faz crescer ainda mais. Atualmente, a montanha de material piroclástico já tem 815 metros de altura e cresce pelo menos 5 metros todos os anos.
A última erupção de Anak Kracatoa ocorreu em 2009 e constantemente a montanha é colocada sob risco 2 de erupção. Saber se Kracatoa vai produzir uma nova erupção igual a de 1883 é uma tarefa árdua, o que torna o trabalho de observação extremamente importante, seja através de instrumentos inseridos diretamente na montanha ou através de imagens de satélites, que o orbitam diariamente.